More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5000 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  53.01 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 188 aa  121  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 192 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  35.06 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 196 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 184 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 		 187 aa  96.7  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  28.98 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 		 281 aa  81.3  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  41.23 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  33.77 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  33.1 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  33.1 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  33.1 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  33.1 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  33.1 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  33.1 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  33.1 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  33.1 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3745  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  29.48 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0010  MutT/nudix family protein  35.83 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  31.01 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3598  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  33.74 
 
 		 210 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  38.71 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.43 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  30.72 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  37.78 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  39.33 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  37.63 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  28.14 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  30.83 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  29.45 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  36.56 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  28.14 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1768  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00835912  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  32.5 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  37.63 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  27.95 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>