More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0039 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 183 aa  368  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  42.6 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 186 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 190 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  39.08 
 
 		 265 aa  119  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 192 aa  97.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1242  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0010  MutT/nudix family protein  34.09 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 184 aa  91.7  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 189 aa  90.9  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  34.4 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 183 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  32.95 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 166 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  36.8 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  35.2 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  31.79 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  36.03 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3745  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.43 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  29.14 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  32.91 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.91 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.91 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  32.91 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.91 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.91 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  36.92 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  38.17 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  30 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  33.85 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.28 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.1 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  32.58 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  38.94 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>