288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1489 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 173 aa  345  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  60.23 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  58.68 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  54.65 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  54.65 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  54.65 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  55 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  49.42 
 
 		 190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  52.91 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  49.1 
 
 		 193 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4797  NUDIX hydrolase  51.81 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868054  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  47.67 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  41.28 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  42.44 
 
 		 174 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  43.29 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  37.87 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  42.69 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  38.1 
 
 		 192 aa  98.2  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 		 201 aa  91.7  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 180 aa  84  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 179 aa  84  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  41.71 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  40.36 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  31.36 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 215 aa  74.3  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 208 aa  73.9  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3598  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  27.71 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  30.92 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  25.61 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  33.53 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  25.3 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  34.38 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  31.21 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 196 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  25.3 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  24.56 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  29.11 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  37.06 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>