More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2546 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 141 aa  291  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  99.29 
 
 		 141 aa  288  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  98.58 
 
 		 141 aa  287  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  98.58 
 
 		 141 aa  287  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  98.58 
 
 		 141 aa  287  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  98.58 
 
 		 141 aa  287  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  86.52 
 
 		 141 aa  258  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  87.23 
 
 		 141 aa  258  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  87.23 
 
 		 141 aa  258  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  86.52 
 
 		 141 aa  257  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  86.52 
 
 		 141 aa  257  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2405  NUDIX family hydrolase  99.17 
 
 		 120 aa  244  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3392  hydrolase, NUDIX family  98.33 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  75.18 
 
 		 141 aa  221  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  32.26 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 255 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  29.69 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  31.4 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  30.16 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  30.65 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  30.16 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  32.23 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  32.23 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  30.65 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  33.06 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  30.65 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  31.82 
 
 		 316 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0880  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.577802  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  29.84 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  30.09 
 
 		 187 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  30.65 
 
 		 269 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  30.58 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  30.65 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  30.58 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  49.15 
 
 		 570 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  29.41 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 		 129 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  29.84 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  29.37 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  34.51 
 
 		 312 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 		 334 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  26.19 
 
 		 396 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  25.76 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  29.55 
 
 		 400 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  28.36 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  26.23 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  24.63 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  28.68 
 
 		 314 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  48 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  28.46 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  28.1 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.08 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>