More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2480 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 141 aa  291  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  99.29 
 
 		 141 aa  291  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  99.29 
 
 		 141 aa  290  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  99.29 
 
 		 141 aa  289  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  98.58 
 
 		 141 aa  287  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  87.94 
 
 		 141 aa  260  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  87.23 
 
 		 141 aa  259  8e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  87.23 
 
 		 141 aa  259  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  87.23 
 
 		 141 aa  259  8e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  87.23 
 
 		 141 aa  259  8e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  87.23 
 
 		 141 aa  258  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  74.47 
 
 		 141 aa  224  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3392  hydrolase, NUDIX family  87.5 
 
 		 120 aa  221  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2405  NUDIX family hydrolase  86.67 
 
 		 120 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  34.23 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  32.33 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  34.71 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  34.71 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  32.26 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  31.45 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  32.26 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  34.71 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  31.4 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  29.37 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  29.37 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  40.45 
 
 		 570 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  29.37 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  30.65 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  31.45 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  29.75 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  29.77 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  28.23 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  29.32 
 
 		 400 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 142 aa  50.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  30 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  31.5 
 
 		 365 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  33.06 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2021  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 299 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  33.9 
 
 		 312 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  28.93 
 
 		 347 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 334 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0880  NUDIX hydrolase  24.09 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.577802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  26.27 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  31.39 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  32.23 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  31.88 
 
 		 316 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  31.93 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.37 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0455  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>