80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0880 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0880  NUDIX hydrolase  100 
 
 
132 aa  274  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.577802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  26.28 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  26.28 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 
141 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  26.28 
 
 
141 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  26.28 
 
 
141 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 
141 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
129 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  24.09 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  24.09 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  24.09 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  23.36 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  24.32 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3392  hydrolase, NUDIX family  28.07 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  23.36 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  25.93 
 
 
316 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  25.23 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2405  NUDIX family hydrolase  27.19 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  26.36 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  25.4 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.78 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  25.19 
 
 
314 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  25.58 
 
 
316 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  26.55 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.78 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  25.95 
 
 
314 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  25.95 
 
 
314 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  25.19 
 
 
314 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  36.23 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  24.43 
 
 
313 aa  42.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.48 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  30.12 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  38.98 
 
 
317 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  25.19 
 
 
315 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  24.32 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4696  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
149 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67554  normal  0.0300067 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 
136 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  34.55 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30 
 
 
132 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  34.55 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  21.82 
 
 
155 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  28.72 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 
133 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
101 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  34.78 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  24.78 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.59 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  21.5 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.08 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.9 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  25.89 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  24.79 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  24.44 
 
 
315 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  29.36 
 
 
136 aa  40.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  23.53 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  38.33 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  31.34 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  38.33 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  38.33 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  38.33 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.46 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  38.33 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.9 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  40.48 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  38.33 
 
 
149 aa  40  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.9 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  24.39 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  24.14 
 
 
151 aa  40  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  37.7 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.9 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0193  NUDIX hydrolase  26.8 
 
 
136 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
134 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>