More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37240 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 136 aa  277  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 		 525 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  39.39 
 
 		 153 aa  90.1  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  37.14 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0038  mutator MutT protein  41.67 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.934517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 		 565 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  31.71 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  43.62 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1482  NUDIX family protein  33.66 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0365982  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1017  NUDIX family protein  31.43 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.686526  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1615  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 298 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1590  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  31.78 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  27.05 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4170  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0195  ADP-ribose pyrophosphatase  46.77 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.65 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.2 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.84 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.84 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.84 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1038  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.65 
 
 		 175 aa  50.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  36 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2785  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.65 
 
 		 175 aa  50.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 334 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  28.36 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  32.69 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  36 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.34 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  32.38 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6325  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.48 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776975  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  32.38 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  26.4 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  29.49 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 252 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  31.31 
 
 		 360 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1508  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  27.12 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  37.66 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  26.4 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1436  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  27.78 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  44.44 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1950  hypothetical protein  32.29 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00937035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 335 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  36.26 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0128  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0968691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  34.13 
 
 		 329 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  34.13 
 
 		 329 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>