260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1502 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  100 
 
 
139 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23100  hypothetical protein  54.74 
 
 
145 aa  149  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691399  hitchhiker  0.00085888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6325  NUDIX hydrolase  53.44 
 
 
148 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1950  hypothetical protein  54.74 
 
 
145 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00937035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1436  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 
141 aa  130  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0195  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 
148 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1974  MutT/nudix family protein  48.48 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0128  NUDIX hydrolase  52.67 
 
 
139 aa  122  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0968691  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2319  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
147 aa  104  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.734141  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  43.31 
 
 
183 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  42.39 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 
525 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  40.96 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0384  hypothetical protein  28.89 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233083  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  50 
 
 
565 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  36.25 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  51.06 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  35.4 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 
144 aa  50.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0038  mutator MutT protein  31.58 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.934517  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  45.9 
 
 
347 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  32.71 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  37.5 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  37.7 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
162 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  42.42 
 
 
302 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  42.42 
 
 
352 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
148 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  47.83 
 
 
320 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  47.83 
 
 
320 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  42.42 
 
 
352 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
291 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  34.85 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  49.02 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  32.31 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1590  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  33.03 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  48 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.91 
 
 
360 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
167 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  43.14 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1615  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3020  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.54 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614658  normal  0.0272519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0169  dinucleoside polyphosphate hydrolase  50 
 
 
173 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.96 
 
 
396 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  32.14 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  39.39 
 
 
318 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  28.72 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  42.86 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4142  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 
173 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  43.14 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
200 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
165 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
282 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  38.1 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  38.1 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1508  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  42.86 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 
174 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 
174 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  30.84 
 
 
153 aa  43.5  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  30.84 
 
 
164 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  40 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0901  dinucleoside polyphosphate hydrolase  50 
 
 
164 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  30.84 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  45 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  30.84 
 
 
164 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  40.38 
 
 
314 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  30.84 
 
 
164 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
146 aa  43.5  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  41.79 
 
 
314 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0170  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.55 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>