244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0555 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  100 
 
 
174 aa  343  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  100 
 
 
174 aa  343  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  99.43 
 
 
174 aa  342  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  74.71 
 
 
217 aa  246  9e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0706  NUDIX hydrolase  80.59 
 
 
179 aa  239  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0747129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0199  NUDIX hydrolase  77.65 
 
 
180 aa  226  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  62.96 
 
 
160 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  53.8 
 
 
156 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 
291 aa  131  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  50.32 
 
 
153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  50.97 
 
 
161 aa  124  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  45.93 
 
 
170 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  43.64 
 
 
299 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  46.3 
 
 
287 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
335 aa  118  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 
176 aa  110  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  45.62 
 
 
165 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 
181 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 
167 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  45 
 
 
165 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  40.88 
 
 
484 aa  97.1  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  41.82 
 
 
305 aa  95.9  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  38.18 
 
 
475 aa  94.7  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
292 aa  88.2  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  32 
 
 
135 aa  58.9  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  37.72 
 
 
145 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.51 
 
 
156 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
211 aa  51.2  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
149 aa  50.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.23 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  40.91 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  40.91 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  39.68 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  42.86 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  48.98 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.82 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
154 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  29.46 
 
 
524 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  44.44 
 
 
154 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  38.1 
 
 
132 aa  48.5  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  48.98 
 
 
154 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
221 aa  48.5  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  46 
 
 
314 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
221 aa  48.5  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  48.98 
 
 
154 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  41.27 
 
 
130 aa  47.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  47.06 
 
 
154 aa  47.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  47.06 
 
 
154 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.68 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  47.06 
 
 
141 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  47.06 
 
 
141 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1856  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
166 aa  47.4  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  27.05 
 
 
156 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  33.33 
 
 
136 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 
155 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  27.05 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
133 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  35.71 
 
 
128 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
168 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  30.25 
 
 
137 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  33.82 
 
 
133 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  32.28 
 
 
383 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
133 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
136 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
136 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0533  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0466336  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
334 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.98 
 
 
128 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.98 
 
 
128 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  29.27 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  37.25 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.98 
 
 
128 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  25.83 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  50 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  42.86 
 
 
129 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  39.68 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 
195 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  40.38 
 
 
134 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  40.38 
 
 
134 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  29.06 
 
 
134 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
133 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  46.67 
 
 
130 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0160  ADP-ribose diphosphatase NudE  35.19 
 
 
182 aa  45.4  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  41.27 
 
 
132 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0141  ADP-ribose diphosphatase NudE  35.19 
 
 
182 aa  45.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 
131 aa  45.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  38.1 
 
 
130 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  29.06 
 
 
135 aa  45.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
138 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  38.1 
 
 
130 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 
208 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>