120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0128 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0128  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0968691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23100  hypothetical protein  52.52 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691399  hitchhiker  0.00085888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1950  hypothetical protein  51.8 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00937035  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  52.67 
 
 		 139 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6325  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1436  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 		 141 aa  116  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0195  ADP-ribose pyrophosphatase  45.11 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1974  MutT/nudix family protein  39.1 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2319  NUDIX hydrolase  43.38 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.734141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 525 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  42.62 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  36.9 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  37.84 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  40.62 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  35.29 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1148  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36667  predicted protein  29.27 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179207 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  38.33 
 
 		 310 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  30.43 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  42.62 
 
 		 329 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  42.62 
 
 		 329 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1856  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015208  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  39.22 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2293  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  30.17 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  28.99 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2461  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442515  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  30.36 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1017  NUDIX family protein  45.45 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.686526  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  33.82 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  43.75 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  29.31 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  37.31 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  39.53 
 
 		 131 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4170  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 151 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 153 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0958  MutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 465 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 144 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  29.55 
 
 		 136 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  58.06 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  58.06 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  29.31 
 
 		 152 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 155 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0906  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000252658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  40.43 
 
 		 314 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  27.54 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  44.19 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3582  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.53 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  58.06 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  58.06 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  27.54 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  42.22 
 
 		 312 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  33.82 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  44.19 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  27.54 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  27.54 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  27.54 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  38.1 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.53 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.53 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  36.54 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1038  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  42.55 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  44.44 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  39.13 
 
 		 334 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0845  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.33 
 
 		 229 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.206164  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  37.5 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1891  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  37.5 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0774  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.33 
 
 		 229 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  33.82 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 174 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  42.67 
 
 		 229 aa  40.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  28.45 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  42.55 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>