136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2293 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2293  NUDIX hydrolase  100 
 
 
162 aa  338  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2193  NUDIX hydrolase  77.98 
 
 
168 aa  263  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52802  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  37.7 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  31.97 
 
 
129 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 
200 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3018  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 
208 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391362  normal  0.0253624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6325  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662138 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 
473 aa  49.3  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
154 aa  48.5  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
196 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
126 aa  47.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  36.36 
 
 
383 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  32.73 
 
 
130 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
282 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
176 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0279  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.113972  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  34.74 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
244 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 
346 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  54.17 
 
 
302 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
291 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  30.77 
 
 
315 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 
346 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  42.03 
 
 
316 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  47.37 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
128 aa  44.7  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
200 aa  44.3  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
128 aa  44.3  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  43.86 
 
 
141 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0128  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
139 aa  44.3  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0968691  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
155 aa  44.3  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
177 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.77 
 
 
346 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.77 
 
 
346 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.77 
 
 
346 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  34.62 
 
 
315 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.77 
 
 
346 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0195  ADP-ribose pyrophosphatase  43.33 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
213 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  29.13 
 
 
400 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1613  NUDIX family hydrolase  32.18 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  37.25 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  35.21 
 
 
199 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2850  NUDIX family hydrolase  32.18 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.482932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1721  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  48.28 
 
 
320 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  49.12 
 
 
320 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
142 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
132 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
132 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  36.59 
 
 
227 aa  42.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
206 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  30.77 
 
 
315 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2023  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 
148 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296194  normal  0.0882034 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2744  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
151 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
134 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 
128 aa  42.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.38 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  42.86 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1470  hypothetical protein  29.55 
 
 
191 aa  42  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
132 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  42.86 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1436  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
141 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 
132 aa  42  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  30.4 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
151 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
143 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
198 aa  41.6  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  31.43 
 
 
181 aa  41.6  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
140 aa  41.6  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
136 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  25.81 
 
 
197 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
136 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.74 
 
 
351 aa  41.6  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
159 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  40.91 
 
 
316 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>