More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2466 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  278  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  84.09 
 
 
136 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  53.17 
 
 
137 aa  147  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  52.34 
 
 
137 aa  147  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_93251  predicted protein  44.53 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  36.18 
 
 
163 aa  96.3  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  42.75 
 
 
337 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49101  predicted protein  38.52 
 
 
174 aa  92  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00569442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  39.84 
 
 
151 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  39.84 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  39.32 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  42.99 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  41.38 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  41.38 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  41.38 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2251  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  56.9 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  33.9 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  39.64 
 
 
524 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0869  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.11667  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  50 
 
 
136 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  31.2 
 
 
168 aa  60.8  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  35.29 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  38.74 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
171 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  31.67 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
171 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  31.82 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
542 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  31.67 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  31.82 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  31.67 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  41.27 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
314 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
183 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  28.32 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  45.76 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0028  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 
171 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
261 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
163 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  31.15 
 
 
363 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 
174 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  32.79 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  50.85 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  40.26 
 
 
154 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  32.79 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  32.79 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
278 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  32.79 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  32.79 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
158 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  32.79 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  32.79 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
228 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  34.78 
 
 
282 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  32.43 
 
 
278 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  39.53 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  38.96 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  37.31 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
184 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>