More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1089 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  56.86 
 
 		 196 aa  164  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  47.26 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  49.64 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  50.74 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  48.53 
 
 		 165 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  49.6 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  48.23 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  44.2 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 144 aa  87.4  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  40.29 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  50.57 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  37.67 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  51.19 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  48.86 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  34.75 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  34.75 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  34.75 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  36.75 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  34.43 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  34.34 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  34.43 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  37.65 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 236 aa  51.6  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 237 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 231 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.56 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.56 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.56 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 225 aa  50.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  30.59 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  44.26 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  35.25 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 229 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  50.77 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  35.71 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.71 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  47.69 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  30.34 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.13 
 
 		 345 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.33 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  28.37 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>