More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1169 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  100 
 
 
138 aa  280  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  88.06 
 
 
144 aa  224  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  66.42 
 
 
154 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  58.91 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
139 aa  94  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  44.7 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 
168 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  40.46 
 
 
147 aa  84  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  40.46 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  41.9 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  34.38 
 
 
473 aa  70.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.54 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  35.9 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  35.9 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  35.04 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  34.19 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  33.61 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  33.33 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  35.04 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  32.48 
 
 
132 aa  62  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
153 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  33.06 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  33.33 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  32.33 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  31.97 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  31.97 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  31.97 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  27.83 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  35.09 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  33.33 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
187 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  30.7 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  35.35 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  35.35 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  50 
 
 
187 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  45 
 
 
130 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
162 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 
174 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  30.7 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5260  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5241  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5317  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5005  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5275  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4834  MutT/Nudix family protein  29.2 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4849  MutT/Nudix family protein  29.2 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5682  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5385  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  29.82 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
187 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  32.48 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  32.48 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  31.01 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  24.43 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  32.48 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
187 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  30.43 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  31.4 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  29.6 
 
 
347 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>