More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2564 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 173 aa  354  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  69.41 
 
 		 182 aa  249  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  44.3 
 
 		 163 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  41.72 
 
 		 184 aa  127  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 188 aa  114  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 281 aa  71.2  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  26.54 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  29.17 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.17 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  29.17 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.17 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.17 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  32.14 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  29.17 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  29.17 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.17 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  28.82 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  35.78 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3717  cytidyltransferase-like protein  33.93 
 
 		 355 aa  62  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 261 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 301 aa  62  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  29.79 
 
 		 269 aa  62  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  40.34 
 
 		 314 aa  61.6  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0679  cytidyltransferase-related domain protein  34.15 
 
 		 344 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  33.33 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0701  cytidyltransferase-like protein  34.15 
 
 		 344 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.962082  normal  0.0273891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.44 
 
 		 345 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 280 aa  60.8  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  26.04 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  32.14 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  28.82 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  28.37 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.89 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  25.9 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  38.89 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  35.45 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  26.9 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 		 346 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 		 346 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 		 346 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0974  cytidyltransferase-like protein  28.67 
 
 		 348 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 		 346 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  32.11 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 		 346 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 262 aa  57.8  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 		 346 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 298 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  36.36 
 
 		 282 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 303 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  31.3 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.78 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  40.54 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  23.53 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  38.89 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  35.09 
 
 		 289 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 294 aa  54.7  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>