More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1261 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 147 aa  289  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  66.91 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  67.42 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  63.5 
 
 		 139 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  61.15 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  58.09 
 
 		 138 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  51.77 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  44.7 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  44.2 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 167 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  44.14 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  38.71 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 196 aa  73.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  40 
 
 		 144 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  37.93 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  42.24 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  42.17 
 
 		 146 aa  67  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  37.11 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  37.11 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  37.11 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  32.77 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  35.34 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  35.34 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  35.34 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  30.08 
 
 		 363 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  36.04 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  35.11 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  37.39 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  32.77 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  36.84 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  26.27 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.75 
 
 		 345 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.48 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  31.21 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.75 
 
 		 345 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.78 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.75 
 
 		 346 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  40.87 
 
 		 260 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  44.58 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.75 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>