More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0154 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  100 
 
 		 147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  90.48 
 
 		 147 aa  282  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  77.7 
 
 		 142 aa  223  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  76.98 
 
 		 142 aa  221  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0229  NUDIX hydrolase  74.15 
 
 		 153 aa  203  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  65.97 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  66.9 
 
 		 179 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  38.02 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  32.31 
 
 		 347 aa  68.2  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  32.87 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  36.07 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  29.75 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  31.93 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  30.17 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  36.84 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.94 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 282 aa  63.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  36.63 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  37.5 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.3 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  33.33 
 
 		 163 aa  62  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  36.7 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  33.04 
 
 		 530 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  33.59 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  30.65 
 
 		 386 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  39.47 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  39.47 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  39.47 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.4 
 
 		 360 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1227  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.756044  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  33.58 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  37.23 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  33.02 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  33.02 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  33.02 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  34.26 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  34.23 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  33.08 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  31.43 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>