291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5556 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 130 aa  259  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 197 aa  87  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  34.17 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  31.15 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  45.57 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  37.65 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  53.45 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  43.33 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4170  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 525 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  48.1 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1482  NUDIX family protein  37.11 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0365982  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 340 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  48.44 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  35.71 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  41.11 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  41.11 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  50 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  35.24 
 
 		 302 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.16 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3194  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 279 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00231464  hitchhiker  0.000000000651054 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0240  mutator mutT protein  28.07 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611039  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1957  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  28.07 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.892636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 291 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2431  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00584965  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 204 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  32.46 
 
 		 524 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  40 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  42.25 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  40 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  40 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  36.79 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  40 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  44.33 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1742  NUDIX hydrolase  23.44 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.445003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  54.72 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  52.5 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  34.04 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  52.63 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  33.07 
 
 		 315 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  73.33 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  38.38 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  35.79 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  47.37 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  47.37 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3598  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1682  SH3-like region  29.31 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00241886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  43.37 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4311  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.317072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  45.61 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  42.86 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  42.86 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10531  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  42.11 
 
 		 306 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  34.52 
 
 		 305 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  45.61 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  45.61 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  35.35 
 
 		 360 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  45.61 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  44.44 
 
 		 199 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>