12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3194 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3194  NUDIX hydrolase  100 
 
 
279 aa  564  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00231464  hitchhiker  0.000000000651054 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  25.35 
 
 
139 aa  48.9  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
130 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
158 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0455  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 
171 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
154 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  25.6 
 
 
139 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3317  hypothetical protein  28.83 
 
 
163 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  38.82 
 
 
292 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 
169 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>