225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3529 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  303  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  59.06 
 
 		 153 aa  184  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  47.26 
 
 		 159 aa  147  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  50.35 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  44.76 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 169 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 174 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 340 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 441 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 327 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  32.03 
 
 		 205 aa  70.1  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 456 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  31.76 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 347 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  33.77 
 
 		 351 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02678  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000336855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2977  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801466  hitchhiker  0.0062852 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.25 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000146788  hitchhiker  0.005493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.25 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02639  hypothetical protein  36.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000320087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.25 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000360016  hitchhiker  0.00252549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3151  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.25 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000021359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000193658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4096  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580084  hitchhiker  0.00923204 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3232  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.25 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  hitchhiker  0.0000853193 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  52.5 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3917  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  21.88 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.71 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  57.58 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  57.58 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  57.58 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0904  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000367518  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.71 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.71 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000442704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  58.82 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  21.88 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  21.88 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  23.68 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1021  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.93 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000480643  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1491  MutT/nudix family protein  41.54 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.627971  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2631  MutT/nudix family protein  27.68 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  62.07 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 193 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.21 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0411  dinucleoside polyphosphate hydrolase  62.5 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229765 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1445  MutT/nudix family protein  41.54 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3260  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.600398  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  53.12 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  53.12 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  53.12 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  64.71 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 155 aa  42  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>