290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3674 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 157 aa  312  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 456 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 441 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 179 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 200 aa  67.4  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 341 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  30.15 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  34.78 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  39.53 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  39.53 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  33.04 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 347 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  30.83 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45.21 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  30.08 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  33.8 
 
 		 351 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  46.3 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 347 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  28.24 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  26.71 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2830  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3044  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  34.83 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  29.32 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67120  hypothetical protein  43.84 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  28.46 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  31.01 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  29.32 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 		 315 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  44.26 
 
 		 365 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  44.26 
 
 		 365 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5820  hypothetical protein  43.84 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  28.7 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 361 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  42.25 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  42.25 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1607  MutT/nudix family protein  28.87 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3081  mutT/nudix family protein  32.23 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  41.1 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  41.1 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  31.06 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 377 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 177 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  29.49 
 
 		 131 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  29.49 
 
 		 131 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  29.49 
 
 		 131 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  42.47 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 305 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  43.28 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  35.59 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  25.86 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  40.51 
 
 		 365 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>