82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1607 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1607  MutT/nudix family protein  100 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  68.82 
 
 		 174 aa  256  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1602  hypothetical protein  100 
 
 		 36 aa  65.5  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 		 237 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 441 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  44.26 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  40.3 
 
 		 570 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  32.58 
 
 		 132 aa  44.7  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 377 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  32.58 
 
 		 132 aa  44.7  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 188 aa  44.3  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4880  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 		 117 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  32.58 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  31.46 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  31.96 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  27.43 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  31.46 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  30.1 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  30.23 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  32.58 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  35.62 
 
 		 400 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  27.42 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  31.46 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  33.71 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  27.43 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  39.34 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  39.34 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  39.34 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 		 143 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 139 aa  42  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  37.7 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  40.32 
 
 		 135 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  26.55 
 
 		 180 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 135 aa  42  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 456 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 		 135 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 		 135 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 		 135 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 151 aa  42  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 176 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 		 132 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1664  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 		 195 aa  42  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 147 aa  42  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 		 135 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  36.11 
 
 		 138 aa  41.6  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  36.11 
 
 		 138 aa  41.6  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 138 aa  41.6  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  26.55 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  32.58 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 		 135 aa  41.2  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  36.11 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  31.46 
 
 		 128 aa  41.2  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 146 aa  41.2  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 134 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 303 aa  40.8  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  32.58 
 
 		 136 aa  40.8  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  24.35 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  40.8  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>