84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0654 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 164 aa  333  9e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  39.44 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 200 aa  90.9  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 340 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 184 aa  87.4  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 441 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 153 aa  84  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  37.58 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 327 aa  81.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  34.81 
 
 		 351 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  29.22 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 347 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  30.09 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  26.35 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  36.23 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  38.89 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2652  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0335859  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1607  MutT/nudix family protein  37.31 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 337 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 337 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 337 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 126 aa  44.7  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  28.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.37 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  37.37 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  55.32 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  69.7 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  26.39 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.48 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 156 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  39.06 
 
 		 164 aa  42  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 180 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  59.38 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  59.38 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  59.38 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  41.27 
 
 		 365 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.48 
 
 		 138 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  40 
 
 		 316 aa  40.8  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 231 aa  40.8  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  41.27 
 
 		 365 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 191 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  28.43 
 
 		 178 aa  40.8  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.48 
 
 		 138 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 390 aa  40.4  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>