74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2288 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 456 aa  882    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  59.96 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1524  NUDIX hydrolase  68.6 
 
 		 260 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1804  NUDIX hydrolase  67.08 
 
 		 260 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807933  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 174 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  63.79 
 
 		 179 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7376  NUDIX hydrolase  52.5 
 
 		 246 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  65.96 
 
 		 169 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  59.51 
 
 		 169 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6630  NUDIX hydrolase  55.42 
 
 		 245 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1073  hypothetical protein  44.35 
 
 		 240 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1729  hypothetical protein  45.78 
 
 		 253 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0592  hypothetical protein  32.77 
 
 		 241 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.323051  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4094  hypothetical protein  40.16 
 
 		 245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0074  hypothetical protein  32.53 
 
 		 256 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1550  Protein of unknown function DUF2210  40 
 
 		 223 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0426394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 390 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27390  hypothetical protein  35.42 
 
 		 247 aa  91.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0368828  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3523  hypothetical protein  38.37 
 
 		 231 aa  86.7  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1598  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1833  hypothetical protein  30.83 
 
 		 252 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1796  hypothetical protein  30.61 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 159 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0260  hypothetical protein  36.42 
 
 		 169 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5481  hypothetical protein  35.83 
 
 		 222 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 157 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1709  hypothetical protein  37.16 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2399  hypothetical protein  39.49 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  31.72 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 137 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  29.26 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 153 aa  66.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  36.18 
 
 		 184 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 165 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 340 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0646  hypothetical protein  30.04 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 		 170 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  38.54 
 
 		 152 aa  55.1  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  29.09 
 
 		 205 aa  54.3  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 		 151 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  25.74 
 
 		 141 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 166 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  28.39 
 
 		 173 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3018  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.71 
 
 		 175 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 149 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  32.43 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  28.16 
 
 		 360 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 169 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 158 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 156 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  31.36 
 
 		 155 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 162 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 168 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  30 
 
 		 169 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 		 155 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  28.39 
 
 		 172 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 162 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0487  MutT/nudix family protein  38.16 
 
 		 151 aa  45.8  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.450276  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  35.06 
 
 		 160 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 158 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 130 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0642  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 179 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138031 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 138 aa  43.5  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 347 aa  43.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 255 aa  43.1  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>