More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2448 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 137 aa  282  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  53.73 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  52.24 
 
 		 153 aa  153  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  47.66 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  42.28 
 
 		 149 aa  115  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 441 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 456 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 347 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 341 aa  60.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 184 aa  57  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  27.35 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  30.22 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  30.82 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  29.1 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  46.55 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.44 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.33 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  39.34 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  28.32 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 237 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  25.9 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  34.21 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  43.33 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  28.32 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  25.9 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  31.82 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  28.87 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  59.52 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  46.3 
 
 		 302 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  59.52 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  40.74 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 		 193 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  27.43 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  59.52 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  41.67 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  41.67 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  29.47 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  59.38 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 337 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 305 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 337 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 		 299 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 337 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  41.82 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1879  mutT/nudix family protein  28.87 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>