109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2912 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 149 aa  297  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  44.37 
 
 		 166 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 151 aa  90.1  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  36 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 164 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  38.6 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 		 200 aa  84.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 347 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  39.07 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  37.01 
 
 		 351 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 179 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 340 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  38.62 
 
 		 174 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 441 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 456 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 341 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2431  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00584965  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  36.59 
 
 		 303 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  33.88 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  31.4 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 337 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 337 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 337 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 		 197 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.31 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  33.33 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2652  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0335859  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  30.58 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 267 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 377 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  26.4 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  26.4 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  26.4 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 155 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 155 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 155 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  26.4 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 158 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  33.87 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  33.56 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0533  NUDIX hydrolase  25.17 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0228598  normal  0.521082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  50 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 120 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  40.98 
 
 		 170 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 137 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 221 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 155 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  25.58 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  25.6 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 		 304 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3260  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.600398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 341 aa  41.2  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 230 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  29.29 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  25.6 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  24.8 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 315 aa  41.2  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 		 208 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  40.35 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  30.17 
 
 		 332 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>