130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2247 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  100 
 
 
337 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  100 
 
 
337 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  100 
 
 
337 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  69.94 
 
 
347 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  72.78 
 
 
347 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  67.06 
 
 
351 aa  364  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  51.18 
 
 
340 aa  269  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
327 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  47.57 
 
 
341 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  60 
 
 
177 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  50 
 
 
174 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 
148 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14980  hypothetical protein  62.5 
 
 
170 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
184 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 
200 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
172 aa  90.5  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
159 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  38.61 
 
 
205 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  39.77 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  43.54 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  38.67 
 
 
183 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  38.6 
 
 
179 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 
137 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  47.93 
 
 
166 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
149 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  39.88 
 
 
167 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  32.21 
 
 
159 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
174 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
153 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  37.67 
 
 
157 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
456 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  40.36 
 
 
177 aa  60.1  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  37.89 
 
 
168 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  40 
 
 
199 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  30.33 
 
 
221 aa  59.7  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
157 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
163 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 
166 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  36.44 
 
 
149 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 
179 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
151 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  40 
 
 
169 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
153 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 
169 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  39.33 
 
 
201 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  31.79 
 
 
234 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
170 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
151 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
155 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
155 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
155 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
155 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
155 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
155 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 
168 aa  53.5  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
305 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  38.98 
 
 
160 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  33.92 
 
 
225 aa  53.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  38.14 
 
 
157 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  38.14 
 
 
160 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  38.14 
 
 
160 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  38.14 
 
 
160 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  38.14 
 
 
160 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  38.14 
 
 
160 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
153 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
166 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
155 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
156 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
156 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 
156 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  50 
 
 
158 aa  49.7  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
171 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
169 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  36.96 
 
 
173 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  46.75 
 
 
180 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  34.92 
 
 
198 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 
178 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
156 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
153 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  38.89 
 
 
135 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
135 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
167 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
156 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  33.33 
 
 
158 aa  46.2  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  32 
 
 
165 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
133 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
171 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
134 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  45.61 
 
 
164 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  31.78 
 
 
146 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>