24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  54.74 
 
 		 221 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  50.46 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  49.77 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  37.5 
 
 		 180 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  38.24 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  34.4 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  35.59 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  36.45 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1984  hypothetical protein  43.01 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470918  hitchhiker  0.00979887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  33.03 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  31.5 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  42.53 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 347 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 337 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 337 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 337 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0822  hypothetical protein  42.39 
 
 		 167 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151964  normal  0.0607124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  29.44 
 
 		 182 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  30.85 
 
 		 180 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>