39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2292 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  341  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  49.43 
 
 		 340 aa  134  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  56.95 
 
 		 347 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  59.46 
 
 		 337 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  59.46 
 
 		 337 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  59.46 
 
 		 337 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  52.29 
 
 		 347 aa  107  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 		 327 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  56.14 
 
 		 351 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14980  hypothetical protein  53.38 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  36.93 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  41.61 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  38.46 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  38.82 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  41.03 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  35.56 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  41.61 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  31.1 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  36.75 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  35.85 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  37.41 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  40.45 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  32.76 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  32.83 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  31.98 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  33.57 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  31.16 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  32.16 
 
 		 225 aa  45.1  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  30.43 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  35.15 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  29.71 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0822  hypothetical protein  45.78 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151964  normal  0.0607124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  29.37 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  26.37 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1984  hypothetical protein  35.62 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470918  hitchhiker  0.00979887 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  27.16 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  34.59 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  28.29 
 
 		 182 aa  40.8  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>