31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2103 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  346  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  60.34 
 
 
179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  60.87 
 
 
181 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  52.98 
 
 
180 aa  141  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  54.1 
 
 
201 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  50.56 
 
 
184 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  41.49 
 
 
225 aa  101  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  41.76 
 
 
198 aa  97.8  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  42.71 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  37.38 
 
 
234 aa  93.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  36.14 
 
 
221 aa  88.6  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0822  hypothetical protein  51.76 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151964  normal  0.0607124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  42.51 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1984  hypothetical protein  45.24 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470918  hitchhiker  0.00979887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  39.05 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  36.78 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  35.71 
 
 
167 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  37.18 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
340 aa  67  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14980  hypothetical protein  45.22 
 
 
170 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  35.22 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
337 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
337 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
337 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
347 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
347 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  40 
 
 
327 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  30.41 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  37.5 
 
 
351 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  21.35 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>