20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1776 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  317  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  90.85 
 
 		 167 aa  280  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2408  hypothetical protein  49.69 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  41.36 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  38.69 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  36.31 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  39.33 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  37.67 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 340 aa  61.2  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  35.71 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  36.78 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 347 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  36.11 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  41.67 
 
 		 221 aa  51.6  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  35.09 
 
 		 201 aa  51.2  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 		 347 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  35.8 
 
 		 184 aa  48.5  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  40.76 
 
 		 327 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  38.16 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  29.35 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>