34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2348 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  353  8.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  48.55 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  51.45 
 
 		 183 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  51.88 
 
 		 181 aa  118  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  41.62 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  42.16 
 
 		 225 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  48.47 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  39.22 
 
 		 234 aa  101  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  42.39 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  31.92 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  44.83 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  37.58 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  40.12 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  37.74 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0822  hypothetical protein  46.63 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151964  normal  0.0607124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 		 341 aa  71.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  40.52 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  35.15 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  40.99 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  35.09 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1984  hypothetical protein  41.67 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470918  hitchhiker  0.00979887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14980  hypothetical protein  46.45 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  28.57 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  26.74 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  37.5 
 
 		 351 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  26.87 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  27.4 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2408  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal  0.0737458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>