108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2095 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 327 aa  625  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  48.14 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  51.31 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  51.32 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  50.16 
 
 		 341 aa  205  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  49.06 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  53.16 
 
 		 337 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  53.16 
 
 		 337 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  53.16 
 
 		 337 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 174 aa  129  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  50.68 
 
 		 177 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  42.7 
 
 		 200 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  42.24 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 		 204 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  39.35 
 
 		 172 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14980  hypothetical protein  65.75 
 
 		 170 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 148 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 184 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  44.79 
 
 		 180 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 		 166 aa  87  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 164 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  38.62 
 
 		 159 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  32.88 
 
 		 159 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  40.28 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 169 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  38.71 
 
 		 167 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  40.76 
 
 		 168 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 169 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  34.96 
 
 		 149 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  38.79 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  40 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  37.08 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  35.23 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  42.44 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 		 151 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  41.29 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  36.9 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 149 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 157 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 169 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  32.27 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  32.39 
 
 		 173 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 		 158 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  34.25 
 
 		 269 aa  49.7  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 153 aa  49.3  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  28.23 
 
 		 143 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 163 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  33.16 
 
 		 225 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 		 167 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 169 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 156 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  28.97 
 
 		 181 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 156 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  41.78 
 
 		 184 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 173 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 142 aa  46.2  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  32.61 
 
 		 186 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 153 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  31.16 
 
 		 183 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 255 aa  45.8  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  34.65 
 
 		 158 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  28.7 
 
 		 150 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 157 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  50.75 
 
 		 142 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  30.41 
 
 		 185 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.98 
 
 		 159 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  27.85 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 141 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  26.62 
 
 		 148 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 168 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 146 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  32.5 
 
 		 154 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  36.08 
 
 		 181 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  30.43 
 
 		 183 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 155 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  26.15 
 
 		 150 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.15 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  31.88 
 
 		 183 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.15 
 
 		 346 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 168 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  36.17 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  28.08 
 
 		 140 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 155 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 158 aa  42.7  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 155 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 155 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 180 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>