106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2563 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  100 
 
 
347 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  84.15 
 
 
347 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  72.78 
 
 
337 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  72.78 
 
 
337 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  72.78 
 
 
337 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  70.69 
 
 
351 aa  363  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  48.54 
 
 
340 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  52.37 
 
 
327 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  45.25 
 
 
341 aa  182  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  57.62 
 
 
177 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  47.97 
 
 
174 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 
200 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14980  hypothetical protein  63.45 
 
 
170 aa  97.1  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  38 
 
 
184 aa  93.6  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
148 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  36.13 
 
 
205 aa  90.5  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 
204 aa  86.3  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  42.86 
 
 
180 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  43.92 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
159 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  39.39 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 
166 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 
149 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  40.37 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  38.78 
 
 
168 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  38.76 
 
 
183 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 
164 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  38.98 
 
 
199 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
153 aa  62.8  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 
151 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  30.15 
 
 
221 aa  61.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  30.82 
 
 
159 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  36.81 
 
 
177 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
153 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 
456 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  37.66 
 
 
201 aa  56.2  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
163 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
157 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  35.29 
 
 
149 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
158 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
157 aa  53.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  52.83 
 
 
181 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
441 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 
174 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  33.91 
 
 
225 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
155 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
155 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 
155 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
166 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 
158 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  39.74 
 
 
159 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  43.53 
 
 
180 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  30 
 
 
167 aa  49.3  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  35.71 
 
 
163 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
160 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  40.37 
 
 
184 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
169 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
169 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  28.09 
 
 
155 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.12 
 
 
158 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
153 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  40.24 
 
 
158 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
156 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  34.13 
 
 
198 aa  46.6  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
168 aa  46.2  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  30 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  34.78 
 
 
143 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
169 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  26.57 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
305 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
156 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
133 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  32.98 
 
 
158 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  28.12 
 
 
159 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  28.12 
 
 
159 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_93251  predicted protein  50 
 
 
148 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
179 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
132 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  37.37 
 
 
160 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  37.37 
 
 
160 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  37.37 
 
 
160 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
144 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  35.63 
 
 
157 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
145 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
170 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
216 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
102 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  34.21 
 
 
135 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  53.66 
 
 
149 aa  43.1  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  37.37 
 
 
160 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>