199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1663 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  100 
 
 
184 aa  362  1e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  57.23 
 
 
200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  52.87 
 
 
205 aa  175  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  53.11 
 
 
204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  48.73 
 
 
172 aa  151  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  46.82 
 
 
174 aa  138  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
340 aa  108  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  38 
 
 
347 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
327 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 
341 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
148 aa  89  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
164 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
347 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  36.53 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  34.25 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
166 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  43.67 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  43.67 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  43.67 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
441 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
456 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  39.05 
 
 
149 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  38.19 
 
 
173 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
174 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 
169 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
169 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
153 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
151 aa  59.3  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
179 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
137 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 
305 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
157 aa  54.3  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
134 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  42.17 
 
 
141 aa  52  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  52.46 
 
 
169 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
165 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
153 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
155 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3567  hypothetical protein  30.83 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.76977  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  51.67 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  50 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  30.92 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  25.35 
 
 
141 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  24.24 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0724  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  51.47 
 
 
170 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  28.03 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 
237 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 
365 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
156 aa  48.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
142 aa  47.8  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 
148 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 
156 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4725  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  33.09 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  45.16 
 
 
139 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3425  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.70639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 
365 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 
365 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
155 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
155 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4074  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.999235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
377 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  44.33 
 
 
130 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
155 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 
156 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  40.32 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0388  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  36.04 
 
 
158 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  40 
 
 
143 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 
142 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  60.61 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  45.36 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  36.08 
 
 
146 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  36.04 
 
 
160 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  36.04 
 
 
160 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
160 aa  45.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1920  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
153 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
152 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  33 
 
 
158 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
152 aa  44.7  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2431  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
132 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00584965  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
137 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  43.86 
 
 
473 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0415  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>