More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0331 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 340 aa  99  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 327 aa  98.2  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 		 174 aa  97.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  40.97 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 		 200 aa  93.6  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 341 aa  92.8  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 347 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 347 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 172 aa  90.5  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  38.51 
 
 		 351 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 184 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 		 204 aa  87  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  36.43 
 
 		 205 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 337 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 337 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 337 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  35.62 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  35.96 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 164 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 441 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  32.89 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 456 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  52.31 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  53.12 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  46.15 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  31.25 
 
 		 258 aa  52.4  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  44.59 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  44.59 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  44.59 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  39.73 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  26.53 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  33.65 
 
 		 430 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  48.15 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  43.24 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  32.74 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  43.24 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  43.24 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  43.24 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  30 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 298 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  43.24 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17300  ADP-ribose pyrophosphatase  42.37 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  27.88 
 
 		 131 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  39.47 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>