More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1382 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  316  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  99.36 
 
 		 156 aa  314  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  99.36 
 
 		 157 aa  314  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  90.32 
 
 		 156 aa  287  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  90.32 
 
 		 156 aa  286  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  87.82 
 
 		 156 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  85.9 
 
 		 167 aa  269  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  79.87 
 
 		 158 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  78.38 
 
 		 160 aa  237  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  78.38 
 
 		 160 aa  237  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  78.38 
 
 		 160 aa  236  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 157 aa  234  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  67.81 
 
 		 149 aa  207  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  66.22 
 
 		 149 aa  206  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  66.23 
 
 		 152 aa  205  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  55.1 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  52.7 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  36.67 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  33.05 
 
 		 399 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0516  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.86 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.48 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.48 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.48 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  39.34 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  39.34 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  34.41 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0573  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.47 
 
 		 203 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.454249 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0569  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.83 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5285  mutT/nudix family protein  28.81 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4843  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.81 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  36.14 
 
 		 524 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.87 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0319  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.81 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5146  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.81 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5378  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.81 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290228  normal  0.0209843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5199  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.81 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  28.33 
 
 		 173 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.33 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5053  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.81 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  39.29 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  39.29 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.33 
 
 		 193 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  43.33 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2110  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.95 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.326827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  38.37 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.29 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2393  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.03 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.783924  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.52 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2785  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.52 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.19 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  31.34 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  29.46 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  30.23 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  28.89 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3671  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.45 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0429  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.97 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.78 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04390  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.97 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.88 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>