More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1103 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  100 
 
 		 524 aa  1070    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  54.04 
 
 		 542 aa  571  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  38.94 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 161 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 162 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.46 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.46 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.46 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 144 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  46.15 
 
 		 156 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  33.87 
 
 		 220 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.65 
 
 		 131 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  35.9 
 
 		 141 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  41.18 
 
 		 435 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 		 137 aa  53.9  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 164 aa  53.9  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.34 
 
 		 139 aa  53.9  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  44.23 
 
 		 153 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 163 aa  53.9  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 142 aa  53.9  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 155 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 147 aa  53.9  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  44.23 
 
 		 153 aa  53.5  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 169 aa  53.5  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 160 aa  53.5  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  34.19 
 
 		 142 aa  53.5  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  44.23 
 
 		 153 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 155 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  44.23 
 
 		 153 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  44.23 
 
 		 153 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 143 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  44.23 
 
 		 153 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  33.96 
 
 		 314 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  44.23 
 
 		 153 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 		 155 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.91 
 
 		 131 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 153 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 130 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  44.23 
 
 		 153 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 162 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30.83 
 
 		 160 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  35.05 
 
 		 148 aa  52.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 314 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  32.17 
 
 		 132 aa  52  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 155 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  48.15 
 
 		 530 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 136 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 157 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 156 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  44.78 
 
 		 347 aa  51.6  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 187 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  49.3 
 
 		 176 aa  51.6  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 183 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  34.55 
 
 		 313 aa  51.6  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 187 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 156 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  61.9 
 
 		 148 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.8 
 
 		 134 aa  51.2  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 158 aa  51.2  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 187 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 187 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 156 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.11 
 
 		 132 aa  50.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  32.09 
 
 		 138 aa  50.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  32.09 
 
 		 138 aa  50.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 194 aa  50.8  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  28.44 
 
 		 155 aa  50.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  32.54 
 
 		 138 aa  50.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 144 aa  50.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 187 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 153 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 142 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  36.62 
 
 		 229 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  31.96 
 
 		 128 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 154 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 155 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 163 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  36.44 
 
 		 137 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 187 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 144 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  30.77 
 
 		 136 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 147 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 157 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 140 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 282 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 		 152 aa  49.3  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  31.07 
 
 		 158 aa  48.9  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  30.95 
 
 		 217 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00240  deadenylation-dependent decapping-related protein, putative  33.93 
 
 		 888 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.390509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 153 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.54 
 
 		 368 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 147 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  43.33 
 
 		 141 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 144 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 195 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 164 aa  48.9  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>