More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8547 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  100 
 
 
156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  55.22 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  52.67 
 
 
230 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  50.99 
 
 
218 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  48.32 
 
 
167 aa  130  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 
169 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  43.23 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  40 
 
 
169 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 
175 aa  103  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  40.4 
 
 
162 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  43.57 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
253 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  38.31 
 
 
282 aa  87.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  40.29 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  38.82 
 
 
255 aa  81.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  31.41 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  44.93 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  47.22 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  63.41 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  55.32 
 
 
158 aa  57.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  58.18 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  36 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  33.86 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
167 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
135 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  47.06 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  47.06 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  35 
 
 
237 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  55.36 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  45.95 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  46.27 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  53.66 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  47.73 
 
 
160 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
155 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  47.06 
 
 
160 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
154 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  50 
 
 
144 aa  52.4  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  40.62 
 
 
159 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  40.62 
 
 
159 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
135 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  42.59 
 
 
258 aa  51.6  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  47.06 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  43.24 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  44.44 
 
 
430 aa  51.2  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  38.1 
 
 
140 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  44.59 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
186 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  44.59 
 
 
137 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  55.36 
 
 
137 aa  51.2  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  41.18 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  51.85 
 
 
347 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 
183 aa  50.8  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  50 
 
 
132 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  50 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  40.79 
 
 
318 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  37.97 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  48.39 
 
 
310 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  45.1 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  50.98 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  45.1 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  45.1 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  45.1 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>