236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3242 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  65.15 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  68.03 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  60.9 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  63.78 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  57.46 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  57.46 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  53.73 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  52.99 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  51.49 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  53.54 
 
 		 193 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  51.13 
 
 		 154 aa  123  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  49.26 
 
 		 175 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 175 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  50.81 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  48.36 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  52.76 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  45.93 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  45.11 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 		 169 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  39.85 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 		 166 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  30.83 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 174 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 215 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 218 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 230 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  42.65 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  26.72 
 
 		 168 aa  48.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  44.23 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  27.78 
 
 		 207 aa  47.8  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 253 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 199 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  28.78 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  27.48 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.77 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.77 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.77 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  30.08 
 
 		 524 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  33 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.77 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.77 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  30.84 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  27.27 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  40.98 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  26.62 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  26.62 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  31.9 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  26.89 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  26.55 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 268 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  31.9 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  45.61 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  27.43 
 
 		 229 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  31.9 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  44.44 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  45.61 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 222 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  31.9 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  44.07 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  41.27 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>