243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2186 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  100 
 
 
165 aa  339  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  60.93 
 
 
151 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  59.6 
 
 
151 aa  183  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  59.6 
 
 
151 aa  183  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  50.66 
 
 
159 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  50 
 
 
158 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  53.42 
 
 
169 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  54.86 
 
 
173 aa  150  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  55.4 
 
 
162 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  55.07 
 
 
162 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 
154 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  58.02 
 
 
175 aa  147  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  50.68 
 
 
193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  55.32 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  52.32 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  48.68 
 
 
163 aa  144  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 
156 aa  141  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  53.73 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
168 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 
175 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  46.31 
 
 
156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  46.4 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
146 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
156 aa  103  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  38.81 
 
 
160 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 
188 aa  77.4  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  36.91 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  28.78 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 
120 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0608  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.108383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
289 aa  50.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  33.06 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  33.33 
 
 
131 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  27.4 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  34.21 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  36.23 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
179 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
134 aa  48.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
167 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
167 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  40.91 
 
 
314 aa  47.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  35.23 
 
 
134 aa  47.4  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 
137 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
150 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
230 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
233 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  27.97 
 
 
168 aa  47  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  35.53 
 
 
181 aa  47  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
131 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
138 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
134 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3429  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
129 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  30 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  25.21 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  25.21 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  25.21 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
130 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  25.21 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
132 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  40.58 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0076  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000742195  normal  0.603343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  28.26 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 
296 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
141 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  45.45 
 
 
319 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  26.5 
 
 
212 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
141 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
140 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>