80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4732 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  100 
 
 
179 aa  357  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  87.72 
 
 
190 aa  305  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  76.57 
 
 
184 aa  254  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  76.57 
 
 
184 aa  254  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  76.57 
 
 
184 aa  254  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  65.32 
 
 
181 aa  218  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  62.57 
 
 
187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  65.03 
 
 
181 aa  210  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  60.84 
 
 
170 aa  199  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  51.2 
 
 
185 aa  168  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  53.93 
 
 
196 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  52.35 
 
 
171 aa  154  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  50.91 
 
 
181 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  51.2 
 
 
188 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  51.81 
 
 
185 aa  149  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  49.41 
 
 
199 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  47.65 
 
 
199 aa  141  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 
197 aa  107  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  42.38 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 
215 aa  84.3  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  29.12 
 
 
184 aa  82  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  38.93 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  38.93 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  21.69 
 
 
185 aa  61.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  27.74 
 
 
185 aa  60.8  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  28.77 
 
 
163 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
205 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
198 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
185 aa  58.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
283 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  26.55 
 
 
548 aa  52.4  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  35.34 
 
 
194 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
191 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  37.17 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  50 
 
 
163 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  29.84 
 
 
164 aa  47.8  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1309  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
122 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  29.51 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  42 
 
 
337 aa  45.4  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  27.56 
 
 
153 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1879  mutT/nudix family protein  28.93 
 
 
149 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  27.56 
 
 
153 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  28.93 
 
 
149 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
210 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
157 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 
149 aa  44.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  20.12 
 
 
188 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 
168 aa  44.7  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  27.56 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5571  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0243609  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
148 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  20.12 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  26.38 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
145 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  31.06 
 
 
152 aa  42  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  34.45 
 
 
149 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2802  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
159 aa  41.6  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.44267  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  27.4 
 
 
149 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
145 aa  41.2  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
182 aa  40.8  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
158 aa  40.8  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  26.77 
 
 
148 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>