63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13930 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 181 aa  358  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  55.23 
 
 		 197 aa  174  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  44.74 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  49.29 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  49.59 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  47.52 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  48.37 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 		 196 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 199 aa  98.2  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  42.76 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  43.1 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  43.1 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  26.92 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  30.27 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  29.08 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  48.33 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  29.48 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  24.86 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  29.37 
 
 		 548 aa  52  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 210 aa  51.2  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  34.42 
 
 		 365 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 283 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  34.42 
 
 		 365 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 320 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  23.31 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 201 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  33.12 
 
 		 365 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  22.7 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  32.5 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 145 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 		 252 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0065  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.783309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 252 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4123  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1309  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 122 aa  40.8  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>