72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1646 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 178 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  50.29 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  49.72 
 
 		 181 aa  184  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  45.2 
 
 		 190 aa  158  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 186 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  49.33 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  47.41 
 
 		 182 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  47.41 
 
 		 182 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 199 aa  94.7  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 199 aa  92.8  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  31.98 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  30.72 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  32.95 
 
 		 185 aa  84.7  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  32.89 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 548 aa  81.6  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  28.32 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  29.56 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  25.29 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  25.15 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  27.95 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  30.52 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  24.29 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  31.37 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  32.94 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3885  hypothetical protein  27.11 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  30.71 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  27.86 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 149 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  24.6 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  26.4 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 303 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14570  ADP-ribose pyrophosphatase  33.93 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0320056  normal  0.156017 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  24.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  26.8 
 
 		 314 aa  42.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  22.48 
 
 		 302 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 144 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 191 aa  42  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  26.61 
 
 		 160 aa  42  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  26.55 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 		 140 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 149 aa  41.2  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0901  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.82 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 		 229 aa  40.8  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>