20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3885 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3885  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  58.56 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  34.2 
 
 		 198 aa  104  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 283 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  23.53 
 
 		 548 aa  67  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  27.11 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  26.44 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  24.02 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  25.55 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  29.13 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  41.2  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  25.35 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>