69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6335 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 181 aa  360  8e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  73.1 
 
 		 181 aa  250  8.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  68.07 
 
 		 170 aa  214  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  65.03 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  61.59 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  59.22 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  59.78 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  59.78 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  59.78 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  56.36 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  55.8 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  56.36 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  53.75 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  50.56 
 
 		 199 aa  157  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  53.01 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  50.91 
 
 		 181 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  45.33 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  42.69 
 
 		 204 aa  98.2  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  41.94 
 
 		 181 aa  95.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  46.38 
 
 		 195 aa  91.3  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  42.41 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  42.41 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  38.93 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  34.92 
 
 		 548 aa  61.2  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  27.34 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  28.8 
 
 		 153 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  31.54 
 
 		 149 aa  51.2  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  28.8 
 
 		 153 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  50.79 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  37.5 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  30.08 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  28 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  22.09 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  29.85 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1879  mutT/nudix family protein  30.25 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 148 aa  44.7  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  28.1 
 
 		 149 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  29.82 
 
 		 143 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  21.47 
 
 		 188 aa  44.3  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  38.24 
 
 		 337 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  25.77 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.09 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 240 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.93 
 
 		 158 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  30.77 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>