68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4848 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 198 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  79.03 
 
 		 187 aa  298  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  45.74 
 
 		 205 aa  144  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  32.65 
 
 		 548 aa  90.5  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3885  hypothetical protein  34.55 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  35.61 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  28.68 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  36.92 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  36.15 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  27.21 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1277  hypothetical protein  29.41 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.744115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  31.54 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  31.54 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  27.45 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  30.61 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 145 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 144 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  28.68 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  33.96 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  23.72 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.14 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3496  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 152 aa  42.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 151 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  28.24 
 
 		 163 aa  42.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  26.58 
 
 		 179 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 136 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 194 aa  42  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  32 
 
 		 186 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 163 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  23.53 
 
 		 146 aa  41.6  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 149 aa  41.6  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 		 184 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 		 184 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  29.73 
 
 		 157 aa  41.2  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 		 184 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>