63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1277 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1277  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  327  5.0000000000000004e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.744115  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 
205 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  28.75 
 
 
198 aa  60.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  31.75 
 
 
548 aa  58.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
149 aa  58.5  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
149 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  26.36 
 
 
283 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 
186 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
146 aa  48.5  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
190 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0855  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  39.71 
 
 
258 aa  46.6  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0230  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
158 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  36 
 
 
96 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  32.61 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  32.61 
 
 
152 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 
136 aa  44.7  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  25.96 
 
 
165 aa  43.9  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  37.14 
 
 
430 aa  43.9  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  32.61 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  32.61 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  30.56 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0862  NUDIX family hydrolase  39.66 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000267263  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.15 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  45.28 
 
 
536 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  32.61 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  25.89 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  32.61 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  32.61 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  32.61 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
230 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1132  NUDIX family hydrolase  32.14 
 
 
157 aa  42  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
143 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 
169 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
156 aa  42  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
158 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 
174 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 
163 aa  42  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  32.61 
 
 
154 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  26.79 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7147  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
198 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0778185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  36.73 
 
 
128 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  29.11 
 
 
141 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 
145 aa  41.2  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  40 
 
 
142 aa  41.2  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
169 aa  40.8  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  30.61 
 
 
149 aa  40.8  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  28.07 
 
 
155 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
154 aa  40.8  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>