102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0632 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  100 
 
 
205 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  48.26 
 
 
187 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  45.74 
 
 
198 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  43.6 
 
 
283 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  36.63 
 
 
548 aa  121  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
186 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3885  hypothetical protein  36.62 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
190 aa  72  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  36.03 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  36.11 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  36.11 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1277  hypothetical protein  42.55 
 
 
166 aa  61.2  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.744115  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
171 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 
149 aa  59.3  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  35.88 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  35.85 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
195 aa  54.7  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
146 aa  52  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
181 aa  51.2  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  39.22 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 
160 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  48 
 
 
142 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  33.55 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0523  NUDIX hydrolase  50 
 
 
187 aa  49.3  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329737  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
163 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
149 aa  48.5  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
147 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
183 aa  48.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  32.26 
 
 
132 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1761  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
149 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
145 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2415  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
173 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 
146 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 
536 aa  45.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
144 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  31.65 
 
 
164 aa  45.1  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 
141 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  58.97 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  59.46 
 
 
132 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2062  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  38 
 
 
373 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  28.78 
 
 
141 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 
147 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 
141 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
162 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0325  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.14 
 
 
170 aa  43.1  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
143 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10096  NUDIX domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11490)  48.78 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2018  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
181 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
239 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  31.06 
 
 
175 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  44.44 
 
 
342 aa  42.4  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
282 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  52.27 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0382  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
153 aa  42  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0152  ADP-ribose pyrophosphatase with uncharacterized conserved domain  36.51 
 
 
312 aa  42  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.34 
 
 
181 aa  42  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
174 aa  42  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 
134 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
141 aa  42  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
205 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  40 
 
 
237 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 
205 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 
205 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  39.29 
 
 
205 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  39.29 
 
 
205 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
227 aa  41.6  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  38.36 
 
 
154 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 
205 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  35.85 
 
 
148 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
244 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  25.78 
 
 
142 aa  41.6  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>