234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0164 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 145 aa  293  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  84.83 
 
 		 145 aa  254  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1326  NUDIX hydrolase  48.65 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0082  NUDIX hydrolase  44.37 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1990  NUDIX hydrolase  44.22 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  37.16 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  34 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  30.66 
 
 		 548 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 204 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 		 191 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  29.73 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  30.71 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2538  hypothetical protein  35.71 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  29.7 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  34.82 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 315 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  36.75 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.29 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  42.22 
 
 		 536 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 361 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  32.84 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.62 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1047  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.27 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 190 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  34.88 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  28.87 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  32.26 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  44 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  41.79 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  35.87 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4880  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  28.15 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  53.33 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  35.87 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  31.9 
 
 		 212 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  27.42 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  34.92 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  29.09 
 
 		 530 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  52.5 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  26.87 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  31.87 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.43 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  56.41 
 
 		 216 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.64 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9420  hypothetical protein  37.89 
 
 		 391 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 254 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>